Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Pkp4Q68FH0 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Pkp4Q68FH0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
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Pkp4Q68FH0 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Pkp4Q68FH0 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Pkp4Q68FH0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Pkp4Q68FH0 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Pkp4Q68FH0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Pkp4Q68FH0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Pkp4Q68FH0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Pkp4Q68FH0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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