Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg9aQ68FE2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Atg9aQ68FE2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Atg9aQ68FE2 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Atg9aQ68FE2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Atg9aQ68FE2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Atg9aQ68FE2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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