Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ctnna3Q65CL1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms