Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim24Q64127 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim24Q64127 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim24Q64127 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim24Q64127 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim24Q64127 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim24Q64127 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim24Q64127 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim24Q64127 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim24Q64127 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim24Q64127 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim24Q64127 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim24Q64127 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim24Q64127 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim24Q64127 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim24Q64127 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim24Q64127 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim24Q64127 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms