Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sall3Q62255 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms