Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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SnrpcQ62241 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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SnrpcQ62241 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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SnrpcQ62241 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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SnrpcQ62241 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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SnrpcQ62241 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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SnrpcQ62241 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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SnrpcQ62241 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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SnrpcQ62241 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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SnrpcQ62241 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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SnrpcQ62241 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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SnrpcQ62241 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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SnrpcQ62241 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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SnrpcQ62241 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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