Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
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Rbm38Q62176 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Rbm38Q62176 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Rbm38Q62176 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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