Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms