Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga6Q61739 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms