Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BcanQ61361 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcanQ61361 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcanQ61361 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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BcanQ61361 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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BcanQ61361 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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BcanQ61361 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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BcanQ61361 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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BcanQ61361 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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BcanQ61361 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BcanQ61361 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms