Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usf1Q61069 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usf1Q61069 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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Usf1Q61069 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Usf1Q61069 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf1Q61069 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf1Q61069 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf1Q61069 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf1Q61069 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf1Q61069 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf1Q61069 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms