Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Grik1Q60934 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Grik1Q60934 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Grik1Q60934 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Grik1Q60934 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Grik1Q60934 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Grik1Q60934 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Grik1Q60934 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Grik1Q60934 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Grik1Q60934 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Grik1Q60934 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Grik1Q60934 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Grik1Q60934 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Grik1Q60934 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Grik1Q60934 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Grik1Q60934 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Grik1Q60934 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Grik1Q60934 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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