Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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