Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CttnQ60598 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CttnQ60598 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CttnQ60598 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CttnQ60598 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms