Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms