Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Trim38Q5SZ99 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Trim38Q5SZ99 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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Trim38Q5SZ99 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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Trim38Q5SZ99 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim38Q5SZ99 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Trim38Q5SZ99 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim38Q5SZ99 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim38Q5SZ99 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim38Q5SZ99 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim38Q5SZ99 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim38Q5SZ99 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim38Q5SZ99 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim38Q5SZ99 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim38Q5SZ99 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim38Q5SZ99 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim38Q5SZ99 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim38Q5SZ99 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim38Q5SZ99 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim38Q5SZ99 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim38Q5SZ99 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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