Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms