Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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