Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Xirp2Q4U4S6 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms