Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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