Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Dnah12Q3V0Q1 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Dnah12Q3V0Q1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Dnah12Q3V0Q1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Dnah12Q3V0Q1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Dnah12Q3V0Q1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Dnah12Q3V0Q1 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Dnah12Q3V0Q1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Dnah12Q3V0Q1 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Dnah12Q3V0Q1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Dnah12Q3V0Q1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Dnah12Q3V0Q1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dnah12Q3V0Q1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms