Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chpf2Q3UU43 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms