Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm6899Q3USS0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Gm6899Q3USS0 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Gm6899Q3USS0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Gm6899Q3USS0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Gm6899Q3USS0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Gm6899Q3USS0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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