Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usp30Q3UN04 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Usp30Q3UN04 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Usp30Q3UN04 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp30Q3UN04 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp30Q3UN04 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp30Q3UN04 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Usp30Q3UN04 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Usp30Q3UN04 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Usp30Q3UN04 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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