Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Hdgfl2Q3UMU9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Hdgfl2Q3UMU9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Hdgfl2Q3UMU9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Hdgfl2Q3UMU9 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Hdgfl2Q3UMU9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Hdgfl2Q3UMU9 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Hdgfl2Q3UMU9 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Hdgfl2Q3UMU9 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Hdgfl2Q3UMU9 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Hdgfl2Q3UMU9 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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Hdgfl2Q3UMU9 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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