Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms