Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Nkx6-3Q3UHX8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Nkx6-3Q3UHX8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Nkx6-3Q3UHX8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
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