Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Gtpbp6Q3U6U5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Gtpbp6Q3U6U5 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Gtpbp6Q3U6U5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Gtpbp6Q3U6U5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Gtpbp6Q3U6U5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Gtpbp6Q3U6U5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Gtpbp6Q3U6U5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms