Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rnf40Q3U319 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rnf40Q3U319 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rnf40Q3U319 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf40Q3U319 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf40Q3U319 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf40Q3U319 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf40Q3U319 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf40Q3U319 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf40Q3U319 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf40Q3U319 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf40Q3U319 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rnf40Q3U319 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rnf40Q3U319 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rnf40Q3U319 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf40Q3U319 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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