Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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