Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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