Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms