Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Cpne9Q1RLL3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Cpne9Q1RLL3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Cpne9Q1RLL3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Cpne9Q1RLL3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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Cpne9Q1RLL3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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