Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms