Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pate4Q09098 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pate4Q09098 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pate4Q09098 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pate4Q09098 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pate4Q09098 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pate4Q09098 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pate4Q09098 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pate4Q09098 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pate4Q09098 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pate4Q09098 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pate4Q09098 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pate4Q09098 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms