Protein–RNA interactions for Protein: Q09014

Ncf1, Neutrophil cytosol factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncf1Q09014 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ncf1Q09014 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ncf1Q09014 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ncf1Q09014 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms