Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms