Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms