Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Cntn3Q07409 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Cntn3Q07409 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Cntn3Q07409 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Cntn3Q07409 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntn3Q07409 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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