Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoc2Q05020 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms