Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox10Q04888 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms