Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlh1Q02576 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlh1Q02576 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms