Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snai1Q02085 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snai1Q02085 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snai1Q02085 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snai1Q02085 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai1Q02085 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai1Q02085 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai1Q02085 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai1Q02085 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai1Q02085 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai1Q02085 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai1Q02085 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai1Q02085 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai1Q02085 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai1Q02085 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai1Q02085 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai1Q02085 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai1Q02085 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai1Q02085 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai1Q02085 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai1Q02085 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai1Q02085 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai1Q02085 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai1Q02085 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai1Q02085 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai1Q02085 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai1Q02085 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai1Q02085 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai1Q02085 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai1Q02085 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai1Q02085 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai1Q02085 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai1Q02085 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms