Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd1Q01822 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms