Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjb2Q00977 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb2Q00977 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms