Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SeleQ00690 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms