Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga4Q00651 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms