Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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Gabpb1Q00420 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Gabpb1Q00420 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Gabpb1Q00420 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Gabpb1Q00420 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Gabpb1Q00420 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Gabpb1Q00420 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Gabpb1Q00420 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabpb1Q00420 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Gabpb1Q00420 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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