Protein–RNA interactions for Protein: Q00342

Flt3, Receptor-type tyrosine-protein kinase FLT3, mousemouse

Predictions only

Length 1,000 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt3Q00342 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Flt3Q00342 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Flt3Q00342 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Flt3Q00342 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Flt3Q00342 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Flt3Q00342 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Flt3Q00342 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Flt3Q00342 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Flt3Q00342 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Flt3Q00342 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Flt3Q00342 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Flt3Q00342 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Flt3Q00342 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Flt3Q00342 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Flt3Q00342 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Flt3Q00342 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Flt3Q00342 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Flt3Q00342 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Flt3Q00342 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Flt3Q00342 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Flt3Q00342 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Flt3Q00342 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Flt3Q00342 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Flt3Q00342 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Flt3Q00342 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Flt3Q00342 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Flt3Q00342 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Flt3Q00342 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Flt3Q00342 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Flt3Q00342 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Flt3Q00342 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms