Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AlkP97793 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AlkP97793 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AlkP97793 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AlkP97793 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AlkP97793 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AlkP97793 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AlkP97793 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AlkP97793 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AlkP97793 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AlkP97793 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AlkP97793 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AlkP97793 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AlkP97793 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AlkP97793 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AlkP97793 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AlkP97793 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AlkP97793 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AlkP97793 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AlkP97793 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AlkP97793 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AlkP97793 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AlkP97793 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AlkP97793 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AlkP97793 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AlkP97793 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AlkP97793 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AlkP97793 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AlkP97793 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AlkP97793 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AlkP97793 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AlkP97793 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AlkP97793 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AlkP97793 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AlkP97793 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AlkP97793 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AlkP97793 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AlkP97793 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AlkP97793 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AlkP97793 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AlkP97793 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AlkP97793 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AlkP97793 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AlkP97793 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AlkP97793 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AlkP97793 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AlkP97793 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AlkP97793 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AlkP97793 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AlkP97793 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AlkP97793 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AlkP97793 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AlkP97793 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
AlkP97793 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
AlkP97793 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
AlkP97793 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AlkP97793 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AlkP97793 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AlkP97793 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AlkP97793 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms